Aloimunní nebo isoimunní neutropenie novorozenců se vyskytuje u plodu v důsledku antigenní neslučitelnosti neutrofilů plodu a matky. Izoantibody matky patří do třídy IgG, pronikají do placentární bariéry a zničí dětské neutrofily. Isoantibodies jsou obvykle leukoaglutininy, reagují s buňkami pacienta a jeho otce, nereagují s buňkami matky.