Mikrodelece sousedních genů na chromozomu způsobují řadu velmi vzácných syndromů (Prader-Willi, Miller-Dicker, Di-Georgie atd.). Diagnóza těchto syndromů byla možná díky zlepšení způsobu přípravy chromozomálních přípravků. V případě, že mikrodeleci nelze detekovat karyotypizací, použijí se DNA sondy specifické pro oblast, která prošla delecí.