Stanovení chromatinu X a Y se často označuje jako metoda rychlé diagnostiky pohlaví. Vyšetřují se buňky z ústní sliznice, vaginálního epitelu nebo vlasového folikulu. Jádra ženských buněk obsahují dva diploidní chromozomy X, z nichž jeden je již v raných fázích embryonálního vývoje zcela inaktivovaný (spirálovitě stočený, pevně sbalený) a je viditelný jako shluk heterochromatinu připojený k jaderné membráně.