Příznaky malabsorpce vitaminu B12 se vyvíjejí od prvních měsíců života dítěte. Zaznamenává se slabost, bledost, opožděný fyzický vývoj, průjem. Neurologické poruchy se zaznamenávají 6–30 měsíců po nástupu prvních příznaků: mentální retardace, neuropatie, myelopatie.