Symptomy malabsorpce vitaminu B12 se vyvíjejí od prvních měsíců života dítěte. Pozorují slabost, bledost, zpoždění ve fyzickém vývoji, průjem. Po 6-30 měsících po nástupu prvních příznaků jsou zaznamenány neurologické poruchy: mentální retardace, neuropatie, myelopatie.