Hlavní systém, který metabolizuje léky, je umístěn v mikrosomální frakci hepatocytů (v hladkém endoplazmatickém retikulu). Zahrnuje monooxygenasy se smíšenou funkcí, cytochrom C-reduktázu a cytochrom P450. Kofaktor je redukovaný NADPH v cytosolu. Léčiva jsou podrobena hydroxylaci nebo oxidaci, která zvyšuje jejich polarizaci. Alternativní reakcí fáze 1 je přeměna etanolu na acetaldehyd za použití alkoholdehydrogenáz, které jsou detekovány hlavně v cytosolu.