Mezi zhoubné nádory jsou nejčastější hepatoblastom a hepatocelulární karcinom. Několik kongenitální anomálie jsou pozorovány zvýšené riziko nádorů jater: hemihypertrophy, renální agenezí nebo kongenitální adrenální Bekuita-Wiedemann syndromem (organomegalie omfalokély, makroglosie, hemihypertrophy), Meckelův divertikl. Níže jsou uvedeny onemocnění, u kterých se také zvyšuje riziko jaterních nádorů.