Základem léčby potravinových alergií je dietní terapie. Pro děti s potravinovými alergiemi je optimální kojení s matkou dodržující hypoalergenní dietu. Pokud matka nemá mléko a je alergická na kravské mléko, používají se sójové směsi (Alsoy, Bonasoya, Frisosoy atd.). V případě intolerance sóji se používají směsi na bázi produktů hydrolýzy s vysokým obsahem bílkovin (Alfare, Alimentum, Pepti-Junior atd.) a částečné hydrolýzy mléčné bílkoviny (Humana, Frisopep).