Inkubační doba chřipky trvá od několika hodin do 2 dnů u chřipky A a až 3–4 dny u chřipky B. Onemocnění začíná akutně, zvýšením tělesné teploty na vysoké hodnoty (39–40 °C), doprovázeným zimnicí, celkovou slabostí, únavou, bolestmi svalů a kloubů. Horečka dosahuje svého maxima koncem prvního, méně často druhého dne onemocnění.