Anomálie struktury ledvinového parenchymu se dělí na megakalyx, Fanconiho chorobu a houbovitou ledvinu. Tyto vývojové vady jsou často doprovázeny zhoršenou funkcí ledvin.
Srůst ledvin je vývojová vada, která se projevuje srůstem dvou ledvin do jednoho orgánu. Tato anomálie se vyskytuje s frekvencí 3,5 % případů mezi všemi vadami ledvin.
Renální dystopie je vývojová anomálie charakterizovaná abnormální polohou ledvinových struktur. Tato vývojová vada se vyskytuje s četností 2,8 % všech vývojových vad ledvin.
Renální hypoplazie je vývojová anomálie charakterizovaná zmenšením velikosti ledviny. Tato vada se vyskytuje s četností 0,9 % mezi všemi anomáliemi ledvin.
Duplikace ledvin je nejčastější malformací ledvin a představuje 10,4 % všech anomálií močových cest. Podle patologických nálezů se duplikace ledvin vyskytuje s frekvencí 1:150.
Ageneze neboli renální aplazie - vrozená jediná ledvina, úplná absence ledviny a ledvinových cév představuje 1 % všech vad. Frekvence anomálie je podle pitevních údajů 1 z 1100.
Anomálie renálních cév se dělí na vrozené vady struktury, množství, tvaru a umístění arteriálních cév a jsou nejčastěji diagnostikovány mezi všemi anomáliemi ledvin a močových cest.
Chylurie je patologický stav, který je doprovázen uvolňováním lymfy močí. Moč má mléčnou barvu. Chylurie vzniká v důsledku píštěle mezi lymfatickým systémem a močovými cestami.
Bakteriurie je patologický stav charakterizovaný přítomností bakterií v moči. Bakteriurie je známkou zánětlivých procesů v ledvinách a močových cestách.