V některých případech, častěji u žen, akutní pyelonefritida začíná s akutní cystitidou (časté a bolestivé močení, bolest v močovém měchýři, terminální hematurie). Jiné příznaky akutní myelonefritidy: obecná slabost, slabost, svaly a bolesti hlavy, nedostatek chuti k jídlu, nevolnost, zvracení.