Encefalitida u planých neštovic je závažné infekčně-alergické onemocnění. Encefalitida u planých neštovic se rozvíjí 3. až 7. den po objevení se vyrážky. Vzácně se encefalitida vyskytuje později nebo v preexantémovém období. Vyskytuje se hypertermie, kómatický stav, křeče, meningeální příznaky, pyramidové a extrapyramidové poruchy.