Přesná příčina vývoje rakoviny penisu nebyla plně prokázána. Je známo, že negativní roli hraje chronické podráždění kůže předkožky smegma a výrobků z bakteriálního rozkladu exfoliovaných epiteliálních buněk, tak u mužů, kteří podstoupili obřízku, že pravděpodobnost vzniku rakoviny penisu, je nižší než u mužů s předkožky uložených.