Meningokoky jsou gramnegativní kulovité buňky o průměru 0,6-0,8 µm. V nátěrech připravených z materiálu odebraného od pacienta mají tvar kávového zrna, často se nacházejí v párech nebo tetrádách, případně náhodně, často uvnitř leukocytů - neúplná fagocytóza.