V současné době je známo 14 sérovarů biovaru Chlamydia trachomatis, které způsobují více než 20 nozologických forem: sérovary A, B, B1, C způsobují trachom a konjunktivitidu s intracelulárními inkluzemi; sérovary D, G, H, I, J, K způsobují urogenitální chlamydie, konjunktivitidu, pneumonii novorozenců a Reiterův syndrom.