Klíšťová encefalitida je způsobena flavivirem, přenášeným klíšťaty rodu Ixodidae. Byly popsány případy nákazy čerstvým mlékem. Po 10denní inkubační době se projevuje jako rýma, horečka, bolest hlavy, bolesti kloubů a léze CNS (encefalitida - 30 %, meningitida - 60 %, meningoencefalitida - 10 %). Očkování proti klíšťové encefalitidě v endemických oblastech vedlo ke snížení incidence.