Aktivovaný protein C štěpí faktory Va a VIIIa, čímž inhibuje proces srážlivosti. Každá z několika mutací faktoru V způsobuje jeho odolnost vůči aktivovanému proteinu C, čímž se zvyšuje tendence k trombóze. Nejběžnější mutací faktoru V je Leydenova mutace. Homozygotní mutace ve větší míře zvyšují riziko trombózy než heterozygotní.