Diencefalon není na preparátu celého mozku viditelný, protože je zcela skryt pod mozkovými hemisférami. Centrální část diencefalonu, hypotalamus, je viditelná pouze na bázi mozku.
Třetí (III) komora (ventriculus tertius) zaujímá centrální polohu v diencefalonu. Komorová dutina má vzhled sagitálně umístěné úzké štěrbiny, ohraničené 6 stěnami: dvěma bočními, horní, dolní, přední a zadní.
Hypotalamus tvoří dolní části diencefalonu a podílí se na tvorbě dna třetí komory. Hypotalamus zahrnuje optické chiasma, optický trakt, šedý tuberkul s trychtýřem a mammilární tělíska.
V přední části každé mozkové hemisféry se nachází čelní lalok (lobus frontalis). Končí vpředu čelním pólem a zespodu je ohraničen laterální rýhou (sulcus lateralis; Sylvian rýha) a zezadu hlubokou centrální rýhou.
Za centrálním sulcusem se nachází parietální lalok (lobus parietalis). Zadní okraj tohoto laloku tvoří parietookcipitální sulcus (sulcus parietooccipitalis). Tento sulcus se nachází na mediálním povrchu mozkové hemisféry, hluboce rozřezává horní okraj hemisféry a přechází na její horní laterální povrch.
Týlní lalok (lobus occipitalis) se nachází za parietookcipitální drážkou a jejím podmíněným pokračováním na horním bočním povrchu hemisféry. Ve srovnání s ostatními laloky má malou velikost.
Spánkový lalok (lobus temporalis) zaujímá dolní boční části hemisféry a je oddělen od čelního a temenního laloku hlubokou boční rýhou. Okraj spánkového laloku, pokrývající ostrovní lalok, se nazývá spánkový kloub (operculum temporale).
Boční komora (ventriculus lateralis) se nachází v tloušťce mozkové hemisféry. Existují dvě boční komory: levá (první), odpovídající levé hemisféře, a pravá (druhá), nacházející se v pravé hemisféře mozku.
