Studie identifikovala bakterie spojené s předčasným porodem

Výzkumníci ze Státní univerzity v Severní Karolíně zjistili, že v jednom vaginálním mikrobiomu může koexistovat více druhů Gardnerella, bakterií někdy spojovaných s bakteriální vaginózou (BV) a předčasným porodem. Zjištění publikovaná v časopise mSystems přispívají k rostoucímu pochopení dopadu Gardnerella na lidské zdraví.

Gardnerella je skupina anaerobních bakterií, které se běžně vyskytují ve vaginálním mikrobiomu. Zvýšené hladiny těchto bakterií jsou charakteristickým znakem bakteriální vaginózy a jsou spojeny se zvýšeným rizikem předčasného porodu, ale vyskytují se i u žen bez známek onemocnění.

„Snažili jsme se pochopit rozmanitost Gardnerelly,“ říká Ben Callahan, docent populačního zdraví a patobiologie na North Carolina State University a spoluautor článku.

„Vědci teprve nedávno začali studovat jednotlivé druhy Gardnerella, takže zatím nevíme, zda různé druhy mohou mít různé účinky na zdraví. Naším hlavním cílem bylo studovat ekologii Gardnerella.“

Unikátní výzvou sekvenování vaginálního mikrobiomu je, že veškeré vzorky se skládají primárně z DNA hostitele, což činí extrakci mikrobiálních dat dražší a pracnější. Prvním úkolem výzkumného týmu bylo vyvinout metodologii, která by umožnila identifikaci různých druhů Gardnerella z dat mikrobiomu.

„Nástroje dostupné pro studium vaginálního mikrobiomu berou všechny gardnerely jako jeden druh,“ uvedla Hannah Bermanová, postdoktorandka na Státní univerzitě v Severní Karolíně a hlavní autorka článku. „Abychom mohli tuto práci provést, museli jsme si vytvořit vlastní databázi genomů gardnerel a vyvinout metodu pro identifikaci různých druhů gardnerel. Doufejme, že to také umožní více výzkumníkům studovat rozmanitost gardnerel.“

Výzkumný tým zkoumal sekvenční data ze tří kohort: dvou náhodných populací těhotných žen a jedné populace s anamnézou předčasného porodu. Analyzovali metagenomické sekvence Gardnerella ze vzorků, aby zjistili, zda existuje souvislost mezi specifickými druhy Gardnerella a předčasným porodem.

Ačkoli nenašli „nezpochybnitelný důkaz“, učinili dva překvapivé objevy.

Nejprve mezi vzorky identifikovali potenciální 14. druh Gardnerella – před touto prací bylo identifikováno pouze 13 druhů.

Zjistili také, že ve většině vzorků, které obsahovaly Gardnerellu, koexistovalo ve stejném mikrobiomu více druhů Gardnerella: v jednotlivých vzorcích bylo nalezeno od dvou do všech 14 známých druhů Gardnerella.

„Obvykle, pokud nějaký druh bakterie kolonizuje prostředí, očekáváme, že vyloučí blízké příbuzné, kteří zaujímají stejnou ekologickou niku a spotřebovávají stejné zdroje,“ říká Callahan. „Často říkám, že s bakteriemi je možné cokoli, ale to je stále neobvyklé. Také jsme viděli, že když je celková mikrobiální zátěž vyšší, Gardnerella tvoří větší část této zátěže.“

„Stále přibývá důkazů o tom, že Gardnerella souvisí s předčasným porodem, ale detaily tohoto vztahu jsou složité. V této práci jsme nenašli jeden škodlivý druh Gardnerelly – možná jsou škodlivé všechny. To zdaleka není konec příběhu.“

Vědci doufají, že se budou dále zabývat otázkami koexistence druhů a složení mikrobiomu.

„Vaginální mikrobiom je nedoceněn,“ říká Callahan. „Například v něm často dominuje jeden druh Lactobacillus, který vytváří prostředí vylučující ostatní bakterie. Když ten zmizí, je tam Gardnerella. Jak tedy tyto bakterie interagují?“

„Odpovědi na tyto otázky by mohly vést k účinnější léčbě bakteriální vaginózy a způsobům, jak předvídat a předcházet předčasnému porodu. Tato práce je v tomto procesu důležitým krokem.“